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Le microbiote intestinal aux commandes : sommes nous vraiment libres ?

Et si notre liberté n’était pas totalement entre nos mains, mais aussi entre celles des milliards de micro-organismes au sein de notre système digestif? Le microbiote intestinal, aussi surnommé le « deuxième cerveau », influence nos émotions, nos envies et même certaines de nos décisions. Cette armée de bactéries, virus et champignons communique en permanence avec notre cerveau, façonne notre bien-être et pourrait jouer un rôle clé dans notre rapport à la liberté intérieure. 

Notre intestin est bien plus qu’un simple organe de digestion et joue un rôle crucial dans la gestion de nos émotions. Le secret de cette influence provient de son lien direct avec notre cerveau, connu sous le nom « d’axe intestin – cerveau ». Ce chemin de communication se fait principalement grâce au nerf vague1 et permet à l’intestin d’envoyer des informations au cerveau et vice-versa. Fait surprenant, 90 

Mais ce n’est pas directement l’intestin qui est responsable de tout cela, mais bien les micro-organismes qui composent notre flore intestinale. Certaines bactéries produisent des substances chimiques apaisantes tandis que d’autres peuvent induire des sensations de stress. Lorsque cette flore est perturbée — un phénomène appelé dysbiose2 — le message envoyé au cerveau peut changer et entraîner un déséquilibre entre bien-être et anxiété. 

Depuis une dizaine d’années, l’étude des liens entre microbiote intestinal et les troubles neuropsychiatriques ne cessent de se développer. Il est aujourd’hui connu qu’un déséquilibre de la flore intestinale a aussi des conséquences profondes sur notre santé mentale et notre personnalité.  Par exemple, les troubles de consommation d’alcool constituent un problème de santé publique. Une équipe de l’université d’Oxford a prouvé en 2014 que plus les altérations de la composition du microbiote étaient importantes, plus les symptômes de dépression, d’anxiété et de manque étaient intenses. De plus, les troubles comportementaux — isolement ou agressivité — les plus importants étaient liés aux patients ayant la dysbiose la plus forte. 

Il a été également été observé que les patients souffrant de schizophrénie présentent une flore intestinale qui évolue en fonction de la sévérité de leurs comportements agressifs. Autrement dit, l’état de leur microbiote pourrait être lié à l’intensité de leurs symptômes psychologiques. De plus, l’équipe de Stéphanie Grabrucker, a montré en 2023 qu’il est possible de provoquer la maladie d’Alzheimer chez des rats en leur transférant simplement le microbiote intestinal de patients atteints de cette maladie. Cela suggère que les déséquilibres intestinaux peuvent même influencer des troubles cognitifs graves. 

Un autre exemple frappant est celui des troubles dépressifs, qui touchent plus de 250 millions de personnes dans le monde. Une étude réalisée en 2020 par l’Institut Pasteur, l’INSERM et le CNRS a révélé un lien entre la perturbation de la flore intestinale et la diminution de certaines substances chimiques responsables de l’état dépressif. Il a même été démontré que le transfert du microbiote intestinal d’un patient dépressif dans un patient sain peut suffire à déclencher une dépression chez ce dernier. La disparition de certaines bactéries capables de produire des molécules appelées endocannabinoïdes — substance similaire au composant actif du cannabis — empêche ces composés d’atteindre une région du cerveau associée à la formation des souvenirs et des émotions, induisant un état dépressif.

Bien sûr, le microbiote intestinal n’est pas le seul facteur déclencheur de ces troubles, car un déterminisme génétique joue également un rôle. En réalité, c’est souvent une combinaison de plusieurs facteurs qui favorise le développement de ces maladies, lesquelles, à leur tour, peuvent aggraver la dysbiose intestinale, créant ainsi un cercle vicieux.

Mais alors, sommes-nous vraiment libres, ou sommes-nous sous l’influence invisible d’un monde microscopique qui détermine une grande partie de nos comportements ? Ce lien complexe entre notre microbiote et nos états émotionnels nous confronte à une question existentielle : si nos pensées et émotions sont influencées par des milliards de bactéries, quelle part de nous reste véritablement libre ? Peut-on encore revendiquer notre autonomie dans un corps où chaque cellule, chaque bactérie, semble avoir son mot à dire ?

Cependant, en comprenant mieux les mécanismes qui lient notre microbiote à notre état mental, nous avons une opportunité de retrouver un certain contrôle. Plutôt que de voir cette influence comme une forme de déterminisme — génétique ou liée au mode de vie — elle peut être perçue comme une invitation à une nouvelle forme de liberté : celle de comprendre, d’ajuster et de maîtriser ces forces invisibles pour mieux vivre en harmonie avec nous-mêmes. 

Notes

  1. Nerf reliant notre cerveau à différents organes et envoyant des informations bi-directionnelles. ↩︎
  2. Microbiote intestinal différent de sujets en bonne santé. Cela peut concerner les espèces bactériennes présentes ou les fonctions (production de molécules) qu’elles sont en mesure de réaliser. ↩︎

Sources

s.n., « Le microbiote intestinal participe au fonctionnement du cerveau et à la régulation des humeurs­ » Institut Pasteur, 9 décembre 2020, URL  : https://www.pasteur.fr/fr/espace-presse/documents-presse/microbiote-intestinal-participe-au-fonctionnement-du-cerveau-regulation-humeurs-0 [Consulté le 14 mars 2025]

Leclercq S. et al. « Intestinal permeability, gut-bacterial dysbiosis, and behavioral markers of alcohol-dependence severity » Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 6 octobre 2014, URL :  https://www.pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.1415174111 [Consulté le 14 mars 2025]

Rambaud Aude, « Santé mentale : le nerf vague lié au microbiote et à la dépression » INSERM, 11 décembre 2023. URL :  https://www.inserm.fr/actualite/sante-mentale-le-nerf-vague-lie-microbiote-et-depression/  [Consulté le 14 mars 2025]

s.n., « La composition du microbiote intestinal pourrait influencer nos prises de décision » Institut du Cerveau, 6 mai 2024, URL : https://institutducerveau.org/actualites/composition-microbiote-intestinal-pourrait-influencer-nos-prises-decision [Consulté le 14 mars 2025]

Rincel Marion, « Stress et microbiote : comment l’intestin influence nos émotions » Microbiome Foundation, 6 avril 2021, URL : https://microbiome-foundation.org/stress-et-microbiote/ [Consulté le 14 mars 2025]

Cohen Amber, « Le lien entre l’intestin, l’humeur et le comportement », Fondation Canadienne de la Santé Digestive, 28 août 2023, URL : https://cdhf.ca/fr/le-lien-entre-lintestin-lhumeur-et-le-comportement/ [Consulté le 14 mars 2025]

s.n., « Maladie d’Alzheimer : la culpabilité du microbiote intestinal » Microbiota Institut, 2 mai 2024, URL : https://www.biocodexmicrobiotainstitute.com/fr/maladie-dalzheimer-la-culpabilite-du-microbiote-intestinal [Consulté le 14 mars 2025]

s.n., « Maladie d’Alzheimer : la culpabilité du microbiote intestinal » Microbiota Institut, 14 mai 2024, URL : https://www.biocodexmicrobiotainstitute.com/fr/schizophrenie-quand-lagressivite-prend-aux-tripes [Consulté le 14 mars 2025]

Crédits photographiques : Gut-microbiota composition could influence social behaviour through the precursor of dopamine, a neurotransmitter involved in brain-reward mechanisms, (Envato Elements pic), licence Creative Commons Attribution 4.0 International, Free Malaysia Today, https://www.freemalaysiatoday.com/category/leisure/2024/05/30/does-gut-microbiota-play-a-role-in-decision-making/.

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